這里有國家重點保護樹種香果樹、天女花、鵝掌楸；有安徽特有樹種永瓣藤；有高大喬木藍果樹、暖木、南紫薇；有珍貴優良樹種華東楠木、紫楠、檫樹、柞木和多種櫻類樹種；有特用經濟樹種香榧、三尖杉、厚樸、杜仲等；還有一些西南和南方區系的植物種類，如福建假衛矛、粗糠樹，四川清風藤、污毛粗力木、羽葉泡花樹、五月茶、水團花、畏芝、藤黃檀、虎刺、鉤藤、、玉葉金花、粵蛇葡萄等；在茂密林下和溝谷旁，常見有黃蓮、八角蓮、七葉一枝花、胭脂鳳仙花，玉竹、鹿蹄等珍貴藥草；藤木植物有五味子、山葡萄、獼猴桃、五葉木通等；在海拔700-800米的山谷兩側，有省內罕見的小面積高大的南紫薇片林分布。

在牯牛降的密密森林中，還隱藏著一個喧囂而繁盛的動物世界，其中與被列為國家重點保護的梅花鹿、蘇門羚（土四不象）、黑麂、云豹、短尾猴、獼猴、小靈貓、水獺、白鷴、白勁長尾雉、鴛鴦、貓頭鷹等。各種森林鳥類、蛙類資源也很豐富。這里還是一個蛇的王國，首次考察就發現38種，國內罕見。