博物館歷史
博物院于1933年籌建，1948年建成，主殿模仿天津獨樂寺山門的模樣。2009年擴建，2013年11月6日對外開放后，成了僅次于中國國家博物館的中國第二大博物館，共設歷史館、特展館、數字館、藝術館、民國館、非遺館六館。

博物館布局
博物院的主要建筑分左右兩塊，右邊走一段路后是仿獨樂寺的博物館老主殿，現已不再用作陳列展品，而成了安檢的地方，“獨樂寺”后是歷史館，其他五館都在左手邊。你既可以從左邊五館游覽到右邊歷史館，也可以從歷史館游覽到左邊五館。建議先去歷史館，因為有“鎮院之寶”的特展館就在歷史館左側，可按歷史館-特展館-數字館-民國館-藝術館-非遺館的順序，游覽完整個博物院。

歷史陳列館
歷史館陳列著從遠古到明清按時代順序排列的文物，行走其中，好像漫步于江蘇上下五千年的文明里。值得一看的有：遠古時代的恐龍骨架；金縷衣、銀縷衣；南北朝時用一塊塊磚砌成的墻，細看上面隱隱刻著“竹林七賢”的磚雕等。

特展館
特展館“盛世華彩”區陳列清朝官窯，“鐘表精品展”陳列中國古代計時器、西洋鐘表，“走進佛像”有金光閃閃的精美佛像。而“鎮院之寶”明正統初年（公元1436-1439年）的鎏金藏式佛塔，一件展品占了一間房間，光那排場就足夠震撼了。這件鎮院之寶出土于南京牛首山的弘覺寺塔地宮，方形的紅色砂巖基臺上，四個青花瓷瓶圍繞著中間的金色佛塔，佛塔的前方有一個小小的金棺銀槨，棺槨上躺著金色釋迦牟尼臥像。

數字館
數字館用現代技術展現古代題材，展品諸如動畫《南都繁繪景物圖卷》（類似世博會中國館里的清明上河圖）。比較有意思的是，這里有很多互動游戲，你可以觸摸屏幕來玩古代背景的游戲。

藝術館
藝術館陳列雕塑、書法、繪畫。展出的傅抱石的畫，用中國水墨畫來畫東歐的紅頂建筑、廣場和雕塑，還是很特別的。

民國館
民國館把整個室內都做成了民國街道的模樣，南京本來就以“民國”為特色，這個館特別受游客的歡迎。街道上擺著有軌電車，街兩旁民國風鋪子林立并開門營業，出售的當然也是能勾起人回憶的東西。在一家南北雜貨鋪，你可以買到小時候吃過的“老鼠屎”（又名金桔丸）。郵政局可以蓋南京博物院郵戳，郵政局樓上的先鋒書店，在網上與“南京最文藝的店”相關的文章里你一定看到過它的身影，書店服務員都穿著民國服裝，要寄明信片書店也有買郵票。

非遺館
非遺館展出刻板、剪紙、金箔、花燈等民間手工藝。靠近民國館有晚清風格的“老茶館”，能在此欣賞昆曲、白局、評彈等表演，表演參考時間：14:00-16:00。在小劇場則能免費看3D影片，片長約20分鐘。非遺館的小劇場在雙休日與節假日晚上19:00若有傳統曲藝表演，也會對外開放，需要買票。